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Oxford Nanopore lanza Flongle para tests de secuenciación de ADN/ARN rápidos y más pequeños en cualquier ambiente

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El objetivo de Oxford Nanopore es hacer posible el análisis de cualquier cosa viviente por parte de cualquiera y en cualquier lugar. Flongle fue diseñado para acercar aún más este objetivo y también para una secuenciación de bajo costo en cualquier momento. Con su forma compacta, Flongle abre las posibilidades de pruebas a pedido en un amplio espectro de locaciones, desde laboratorios científicos hasta granjas y fábricas, entornos de atención de salud, espacios abiertos o salas de clases.

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Flongle es un adaptador para los dispositivos de secuenciación portátiles MinION y de escritorio GridION X5. Utiliza la misma tecnología de secuenciación de nanoporos centrales que otros dispositivos Oxford Nanopore, por lo que genera datos en tiempo real, secuenciación directa y lecturas largas. Las celdas de flujo Flongle pequeñas actualmente pueden producir hasta 1,8 Gb de datos de secuenciación con margen para más de 3 Gb. Esto permite muchos tipos de experimentos de secuenciación, incluida la secuenciación de genoma pequeño, secuenciación de paneles/amplicones objetivos, metagenómica para la identificación de virus, bacterias o caracterización de microbiomas, o ID de especies. También se puede usar para control de calidad de experimentos con nanoporos más grandes.

A $90 por celda, Flongle permite la secuenciación a pedido en un punto de venta asequible, sin necesidad de esperar por los grandes lotes de muestras que a menudo se requieren para lograr bajos costos por tests en dispositivos de secuenciación tradicionales. El flujo de trabajo es rápido y simple, donde la preparación de la biblioteca demora tan poco como diez minutos, y el análisis de datos es en tiempo real.

El Dr. Matt Loose, de DeepSeq, Escuela de Ciencias de la Vida, Universidad de Nottingham, ha estado probando Flongle en el marco de un programa de acceso temprano. “Hemos estado usando Flongle para pruebas y desarrollo de nuevos protocolos como selección CRISPR/Cas9 para enfocarnos en regiones selectas del genoma humano, y también hemos estado trabajando en nuevas muestras antes de ejecutar a escala en PromethION. Quedamos muy contentos con el producto y el rendimiento en las celdas de flujo en acceso temprano, y esperamos incorporar el Flongle listo para producción en nuestros flujos de trabajo. En realidad será muy interesante ver cómo los usuarios aplican el Flongle en terreno”.

https://twitter.com/mattloose/status/1067115112220295168    

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Miten Jain, de la Universidad de California, Santa Cruz, también ha estado probando Flongle: “La secuenciación basada en Flongle es la mejor manera de controlar una biblioteca de nanoporos. En UC Santa Cruz, ahora rutinariamente secuenciamos bibliotecas de ARN nativo y ADN genómico en un Celda de Flujo Flongle antes de escalarlas para nuestro PromethION. Hemos observado que la secuenciación basada en Flongle es un buen factor para predecir la calidad de la biblioteca y de su rendimiento en el PromethION. Flongle también permite las pruebas experimentales a una escala más asequible y será una parte integral de nuestro trabajo con nanoporos en adelante”.

El Dr. Justin O’Grady es un investigador traslacional de la Universidad de East Anglia, RU. Él ha estado desarrollando métodos de investigación basado en nanoporos para la rápida caracterización metagenómica de patógenos en muestras clínicas de pacientes con neumonía o infecciones del tracto urinario. “Encuentro interesante la manera en que Flongle puede ayudar a identificar patógenos y resistencia antimicrobiana más rápidamente, y cómo tales tecnologías se podrían usar en escenarios mucho más cercanos a pacientes a futuro”. 

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https://twitter.com/Justin_OGrady/status/1055855306754924544

Los paquetes básicos Flongle ahora están disponibles en tiendas e incluyen el adaptador Flongle; los usuarios pueden elegir ejecutarlos en sus dispositivos MinION o GridION. Además, los usuarios podrán comprar celdas de flujo adicionales a $90 cada una. Los protocolos están siendo puestos a disposición y el uso de los actuales kits de preparación ya es compatible con MinION, GridION y PromethION.

Oxford Nanopore ahora está recibiendo pedidos para el MinION Mk1C https://nanoporetech.com/products/minion-mk1c, que combina la secuenciación portátil en tiempo real de MinION con computación poderosa y una pantalla táctil de alta resolución. El dispositivo será compatible con Flongle, lo que permitirá análisis rápidos en terreno; pronto se entregará más información.

Vídeo – https://mma.prnewswire.com/media/834428/Oxford_Nanopore_Flongle.mp4

Foto –
https://mma.prnewswire.com/media/834426/Oxford_Nanopore_Flongle.jpg

Contacto: Zoe McDougall, media@nanoporetech.com

FUENTE Oxford Nanopore Technologies

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SOURCE Oxford Nanopore Technologies

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